一、凈化車間的潔凈度檢測
凈化車間交付使用后不是一勞永逸的，要進行科學的管理和維護。在生產過程要每三個月檢測一次。食用菌生產的凈化車間，主要檢測項目集中在，風速、壓差、單位體積內的粒子數、沉降菌等。檢測又分靜態檢測和動態檢測。檢測過程如果發現那些指標不合格，要及時進行分析，找出產生的原因。
二、凈化空氣調節系統的檢查
1、回風口的檢查
對房間內的回風窗要經常性的檢查，看是不是臟了，過濾網上有沒有其它東西。回風窗要經常擦洗，過濾網每1～2個星期拆卸下來清洗一次。
2、空氣調節箱的檢查
對空氣調節箱內的初效、中效過濾器也要1～2個月檢查一次，注意過濾器前端和后端的壓差變化。要對箱內的臭氧機，風機，空調表冷器及排水等組成部件也要經常檢查，看有沒有異常情況。
3、高效過濾器的檢查
高效過濾器是空氣調節系統中的最重要的設備。高效過濾器要定期每6個月檢查一次，看有沒有變黑，或有沒有其他異常情況（高效過濾器是紙質，因夏天開空調或房間內濕度高可能長霉菌）。這些因素直接決定凈化車間的送風量、空氣潔凈度、菌落數等是否會超標。
4、壓差的檢查
凈化車間在設計時為保證車間空氣平衡不受破壞，氣流能逐漸地從空氣潔凈度高的車間流向潔凈度低的車間，避免室內的潔凈度受到污染空氣的干擾。檢查時潔凈度高的潔凈室比潔凈度低的潔凈室的靜壓值要高5～10Pa，潔凈區比非潔凈區靜壓值要高5～10Pa。如果壓差異常要及時排查。產生壓差異常的原因有:初、中、高效過濾器隨著使用時間的增加，其阻力增加，造成送風量減少，室內正壓值降低。隨著凈化車間投入使用時間的增加，門窗出現漏風現象，造成凈化車間內正壓值發生變化。送風機皮帶松動，送風機轉速降低送風量不足也會造成凈化車間正壓值發生變化。
5、溫濕度的檢測
食用菌在凈化車間內接種，溫度和濕度的控制也很重要。溫度高，濕度大，都會直接影響接種的成品率，要經常檢測溫濕度，發現問題及時解決，為做好合格的產品保駕護航。
食用菌凈化車間從場地的選擇和方案設計，到專業的凈化工程施工，再到使用中的維護和管理，其重要性各占1/3。但對于食用菌的生產企業來說，后期的使用和維護管理卻是重中之重。