對于制藥廠來說，藥廠凈化車間是耗能最高的區域，而對于企業來說，要盡可能的降低藥廠凈化車間的運行能耗，下面我們就談下這個問題。
一、節能凈化產品的開發與應用
1.無隔板過濾器和新型空氣分配裝置可構成既節能又靈活的凈化車間系統。
2.在不影響噪聲限度的前提下，提高風機壓頭有利于延長過濾器的使用壽命，此外風機應能夠變速運行。
3.對各種凈化單元結構（布置和尺寸）應加以改進，使之向有利于減小體積、提高分配均勻性而又不增加阻力的方向發展。
4.改進排風柜的構造，既便于隨時調節風量，又要方便操作。
5.工藝設備的設計和排熱措施應密切結合，排熱以發展水冷為主。
二、運行過程中的注意事項
1.在藥廠凈化車間中，生產工作停止時，排氣柜應減小排風量，新風量亦應隨之調小。
2.根據不同的工藝過程應能有效控制室內換氣次數。
3.與一般空調系統相同，運行中在某些季節應盡可能利用自然的冷卻作用（室外空氣冷卻、冬季利用冷卻塔獲得冷水）。
4.過渡季是否增加新風比，以及值班運行方式是否提前開動運行均應通過經濟比較確定。
5.提高空調凈化系統的自控水平，能夠實現既保證運行質量，又能達到節能的目的。